医院等级甲乙的区别主要是依据医院的规模、技术水平、医疗设备、管理水平、医院质量等方面。
医院分三个等级每级再划分为甲、乙、丙三等，其中三级医院增设特等级别，因此医院共分三级十等。以三级甲等和三级乙等为例：
三级甲等医院建设成绩显著，科室设置、人员配备、管理水平、技术水平、工作质量和技术设施等，按分等标准综合考核检查达900分及以上。三级甲等医院是三级医院中实力最强的
三级乙等医院建设成绩尚好，其科室设置、人员配备、技术水平、工作质量、技术设施等，按分等标准综合考核检查达750-899分。实力比之甲等要差一些
另外医疗收费与医院级别挂钩。级别不同，门诊挂号、住院床位收费等都有所不同。所以三级甲等医院和乙等医院收费标准不一样
:三甲与三乙都是在一个标准上，即基本标准都达到了三级。三级的基本标准是病床数在五百张以上，在医院功能任务、科室设置、人员配备、医院管理(包括医疗、护理、特资、信息、财务、设备等)、科研教学等方面符合国家三级医院的组织要求。
而甲乙之分在于分等标准方面，乙等比甲等要差一些，具体的检杳标准是一千分的标准，达到九百分以上的为甲等，八百分以上的为乙等。